После событий первого турнира Mortal Kombat Лю Кан, Рейден, Джонни Кейдж, Соня Блейд и Джакс возвращаются домой и обнаруживают, что Земное Царство было захвачено силами Внешнего Мира. Злой полководец Шао Кан предъявляет нашим героям ультиматум; согласитесь на новый турнир Mortal Kombat или вступите в тотальную войну с Внешним Миром. Теперь наши герои вместе с новыми союзниками Кун Лао и Страйкером должны отправиться во Внешний Мир и сражаться за выживание в Земном Царстве в турнире, чтобы завершить все турниры.
Мультфильм продолжит сюжет первой части («Смертельная битва: Месть Скорпиона»). Рейден с лучшими воинами Земли — Лю Каном, Джонни Кейджем, Соней Блейд и Джаксом возвращаются на Землю, чтобы обнаружить там армии Внешнего мира. Сам Император Шао Кан предстает перед бойцами, чтобы поставить им очередной ультиматум — или новая Смертельная Битва, или его армии начинают захватывать планету, уничтожая все на своем пути. Вряд ли от такого предложения можно будет отказаться. В новом мультфильме также ожидается появление как новых, так и уже известных персонажей — Страйкера и Смоука, Кан Лао, Саб-Зиро, Джейд и повелительницы болот Ди’Воры. Режиссером мультфильма стал Итан Сполдинг, который работал над первой частью мультфраншизы, а также мультфильмом «Бэтмен: Нападение на Аркхэм». Создатель серии оригинальных компьютерных игр Mortal Kombat Эд Бун выступил в качестве консультанта.